O entendimento da fotografia foi-se alterando ao longo das três últimas décadas, tal como a própria prática fotográfica mudou. Assim, o campo de trabalho dos Encontros de Fotografia foi passando a incluir o amplo sector das artes que lidam com a imagem produzida a partir de sistemas ópticos, ou de lentes, tocando o filme experimental, o vídeo, as inúmeras formas da imagem digital na sua relação com o universo da arte contemporânea. E, assim, também o leque de artistas com que trabalhou ao longo do tempo se ampliou. Constituída por mais de 2500 obras, a colecção dos EF é a visão sintética dos últimos 30 anos, fruto de uma política de encomendas e aquisições que, iniciada nos anos 80, teve o seu maior fulgor nos projectos encomendados a artistas durante os anos 90.

Alguns dos artistas que integram a colecção são: André Cepeda, António Júlio Duarte, Bernard Plossu, Carlos Vidal, Cristina Garcia Rodero, Daguerre, Daniel Blaufuks, Dieter Appelt, Duane Michals, Edgar Martins, Fernanda Fragateiro, Filipa César, Gerard Castello Lopes, Gordon-Matta Clark, Helena Almeida, Henri Cartier Bresson, Jemima Stehli, João Tabarra, Joel-Peter Witkin, Jorge Molder, José Maçãs de Carvalho, Julião Sarmento, Luigi Ghirri, Marianne Müller, Paulo Nozolino, Ralph Eugene Meatyard, Robert Frank, Rui Chafes, Vítor Palla, Walker Evans, Walter Nierdermayr.